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荧光定量 PCR从方法上来说,可分为荧光染料法和荧光探针法。 荧光染料法常用的荧光染料包括: SYBR GreenⅠ、Eva Green 和 Pico Green 等,其中 SYBR GreenⅠ应用最为广泛。SYBR GreenⅠ的最大优势在于可用于监测双链 DNA 序列的扩增,对 DNA 模板没有选择性,通用性强,使用方便,不需要设计和合成复杂的探针,灵敏度高,价格便宜。但是 SYBR GreenⅠ会与体系中非特异性的双链 DNA 结合产生假阳性的信号,影响实验结果的准确性。 荧光探针法分为水解探针和杂交探针两种。TaqMan 探针是最常见也是应用最广泛的水解探针, 可以与互补靶序列进行特异性结合。TaqMan 探针的优势在于特异性高,引物设计相对简单,重复性好;局限性表现在只适合特定的目标,荧光探针不能自行标记,合成价格较高。杂交探针中应用最多的是分子信标。