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代谢重编程(Metabolic reprogramming,MRP)是细胞代谢网络在全局水平上的状态改变,它与细菌耐药性、癌症进展、癌细胞耐药、细胞分化等密切相关。代谢重编程也是科学家控制和改造细胞,用来进行生物制造的核心手段。因此,如何理性地研究认知代谢重编程,并利用它高效地控制细胞代谢已成为众多科学家的迫切需求。 上海交通大学团队提出一种全新理念。他们从细胞感知外界环境刺激的感知基因入手,使用 CRISPR 技术对感知基因进行随机组合干扰,在一个瓶子中就可实现模拟成千上万种不同的环境条件,并对这些环境条件刺激的代谢效应进行测定。 这样就可以轻松地获得细胞的“敏感节点”基因受到刺激后,作出反应的“大数据”。再通过该团队开发的算法,从这些数据中解读出细胞对各种环境刺激做出反应的规律和机制。基于这些机制,人们可以方便地进行代谢网络的重新编程,从而更加理性和方便地控制细胞的代谢。 此外,该团队为这一理念的实施开发了一整套工具箱,包括工具载体、分析算法和实验方法指南。并且,为简化智能代谢重编策略的应用,他们还提供了基于 Web 的一站式服务(https://smrp.sjtu.edu.cn)。