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全球首创,分子之心开源新AI算法,攻克蛋白质侧链预测与序列设计难题

 大鱼Biotech

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蛋白质结构和功能的形成,很大程度上取决于侧链原子间的相互作用,因此,精准的蛋白质侧链预测(PSCP)是解决蛋白质结构预测和蛋白质设计难题的关键一环。但此前蛋白质结构预测大多聚焦于主链结构,侧链结构预测始终是一个未被完全解决的难题。

近日,分子之心许锦波团队推出一种新的PSCP深度架构AttnPacker,在速度、内存效率和整体精度方面取得大幅提升,是目前已知的最优侧链结构预测算法,也是全球首创的可同时进行蛋白质侧链预测和序列设计的AI算法。

相关论文发表在了《美国国家科学院院刊》(PNAS)上,论文题为:An end-to-end deep learning method for protein side-chain packing and inverse folding。其预训练模型、源代码和推理脚本都已在Github上开源。

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回复尘埃未定:预测效果好、效率高、易用,这些优势有利于对于AttnPacker在研究和工业领域的广泛使用。”许锦波教授表示。
回复尘埃未定:我们将基于AI持续探索更精准、更高效的蛋白质预测、设计算法

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