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与病毒赛跑——疫苗动态更新中的定量生物学策略

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近年来,随着对病毒研究进展的迫切需求,人们对病毒基因功能和结构的认识不断深入,优化设计和与病毒“竞赛”研究方向备受关注。传统的与病毒竞赛是通过跟随策略:世界卫生组织(WHO)定期与各个合作中心和实验室的专家进行磋商,分析全球流感病毒数据,为下一个流感季节开发疫苗提供推荐疫苗组分。

这种跟随式的开发策略应用在COVID-19上可能会慢“毒”一拍:以贝塔毒株(Beta,B.1.351)为例,该毒株于2020年12月在社会面大量传播,2021年1月针对贝塔毒株的疫苗开始临床试验,但在2021年7月2a期临床试验期中分析出炉,传播的主要毒株已变为德尔塔(Delta,B.1.617.2/AY.1)。

是否可以开发新策略能够跑赢新冠突变毒株,使对抗病毒免疫策略能够动态更新呢?

2023年7月31日,中国科学院深圳先进技术研究院、香港大学与贝湾生物科技有限公司合作,在 Cell 子刊 Cell Host & Microbe 上发表了题为:Rational design of booster vaccine strain against COVID-19 based on antigenic distance 的研究论文。

该研究提出了疫苗动态更新的定量生物学策略,发现接种两针基于始祖毒株的疫苗之后,接种基于非典病毒的疫苗可以提供更为长效广谱的保护,并提出“抗原场(Antigenic Field)”理论以更好地理解和定量人体免疫系统与外来抗原之间的相互作用(免疫反应)。

在该工作中,研究团队通过定量建模和理性设计开发了一种可用于疫苗动态更新研究的新型策略,将定量建模应用在新冠病毒逃逸分析中,提出“抗原场”理论,为病毒疫苗开发等提供重要思路。

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