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TALEN 与CRISPR/Cas9技术对比

 基因那些事

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TALEN技术与CRISPR技术均为近年来的热点基因编辑技术,在基因治疗、基因功能研究和种质遗传改良等领域均有广泛的应用。这2个技术体系各有优势。
TALEN 与 CRISPR/Cas9技术对比
1)TALEN技术以蛋白-DNA模式识别靶标序列,CRISPR技术为RNA-DNA识别模式。TALEN技术需要根据靶标序列构建不同的TALEs蛋白,体系构建耗时耗力且成本较高。
而CRISPR技术只需改变一段短sgRNA序列即可实现靶标位点识别功能,体系构建更加简单高效。
同时,由于蛋白与DNA结合效果受DNA甲基化影响,TALEN技术的靶点范围受限于DNA甲基化,CRISPR技术的RNA-DNA识别模式则不受DNA甲基化影响。
2)TALEN技术靶标序列的特异性由串联重复序列结构域的RVDs决定,这4种核苷酸均有相应RVDs进行识别。
理论来讲,TALEN可以靶向基因组的任何一段特异性序列。CRISPR技术则通过识别PAM区进行定点编辑,虽经科学家改造,PAM区对靶点序列识别的范围增大很多,但仍受靶点范围限制。
3)TALEN技术只有形成二聚体才能进行基因组编辑,但TALEN的二聚体基因编辑模式决定了其靶点特异性非常高,编辑效率高,脱靶率低,对细胞的毒性效果较低。
CRISPR只需单个CRISPR/Cas9蛋白复合体即可启动定点编辑,但存在较高的脱靶率,易出现预料之外的编辑效果,有较高的细胞毒性作用。因此,TALEN技术在微生物发酵食品工业方向具有较高的应用潜力。
4)TALEN主要用于基因片段编辑,尚不能实现单碱基编辑功能。
CRISPR技术则通过融合tRNA腺苷脱氨酶、胞苷脱氨酶实现了A与G和T与C间的单位点精确编辑,随着基因功能位点的精确研究,CRISPR在精准位点编辑上的应用前景更广阔。
5)TALEN技术每次只能进行单个靶点的基因编辑,而CRISPR技术可以同时进行多靶点定向基因编辑,在创制微生物育种突变体材料时更加高效。

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