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科学家破译首个耐脱水植物基因组数据库,其中10套为苔藓植物的基因组

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通常情况下极端脱水对植物是致命的,但少数陆地植物在特殊的环境中演化出营养体耐脱水(VDT)的特性。

中科院新疆生态与地理研究所张道远研究团队发布了耐脱水植物基因组数据库Drying without Dying。该数据库整合了丰富的生物信息学分析工具模块,如多种类型的序列比对、同源基因簇搜索、功能检索、GO功能注释和代谢途径富集统计、基因表达谱分析、共表达网络提取,以及每个物种基因组的JBrowser浏览等。

数据库包含26套VDT相关的植物基因组数据资源,其中10套为苔藓植物的基因组。该数据库整合了常用的生物信息学分析工具模块,便于湿实验工作者后续分析和挖掘该类植物基因信息,为苔藓植物和维管植物两大分支在植物耐脱水特性方面的趋异演化提供了基因组和转录组层面的证据。

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